Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHOC2Q9UQ13 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHOC2Q9UQ13 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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