Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNX6Q9UNH7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX6Q9UNH7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX6Q9UNH7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX6Q9UNH7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX6Q9UNH7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX6Q9UNH7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX6Q9UNH7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX6Q9UNH7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX6Q9UNH7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX6Q9UNH7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms