Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms