Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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USP18Q9UMW8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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USP18Q9UMW8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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USP18Q9UMW8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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