Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TPCN1Q9ULQ1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TPCN1Q9ULQ1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms