Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEFF2Q9UIK5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEFF2Q9UIK5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms