Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUX4Q9UBX2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4Q9UBX2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms