Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COPS7AQ9UBW8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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