Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KLHL42Q9P2K6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KLHL42Q9P2K6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms