Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP35Q9P2H5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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