Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms