Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GDE1Q9NZC3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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