Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CACNA2D2Q9NY47 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CACNA2D2Q9NY47 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms