Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms