Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN6Q9NWW5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN6Q9NWW5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms