Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms