Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMC4Q9NTJ3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMC4Q9NTJ3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms