Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CTNNBIP1Q9NSA3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms