Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TM7SF3Q9NS93 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms