Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHST12Q9NRB3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms