Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ASCL3Q9NQ33 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms