Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FANCFQ9NPI8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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