Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
A4GALTQ9NPC4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
A4GALTQ9NPC4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms