Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PNPLA8Q9NP80 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms