Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SRA1Q9HD15 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms