Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms