Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C10orf88Q9H8K7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C10orf88Q9H8K7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms