Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C11orf49Q9H6J7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms