Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PDGFDQ9GZP0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDGFDQ9GZP0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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