Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MTMR12Q9C0I1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms