Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM4Q9C037 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms