Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms