Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms