Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SALL3Q9BXA9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SALL3Q9BXA9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms