Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPATA9Q9BWV2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPATA9Q9BWV2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms