Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNDC11Q9BVV2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms