Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSL1

UBAC1, Ubiquitin-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAC1Q9BSL1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBAC1Q9BSL1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBAC1Q9BSL1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBAC1Q9BSL1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBAC1Q9BSL1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBAC1Q9BSL1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBAC1Q9BSL1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBAC1Q9BSL1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBAC1Q9BSL1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBAC1Q9BSL1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBAC1Q9BSL1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms