Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERPUD2Q9BSE4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERPUD2Q9BSE4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms