Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MESP1Q9BRJ9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms