Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SMIM7Q9BQ49 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms