Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RPS6KC1Q96S38 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPS6KC1Q96S38 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms