Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRC1Q96M27 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRRC1Q96M27 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms