Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM71F1Q96KD3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms