Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF496Q96IT1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms