Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms