Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
C18orf8Q96DM3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C18orf8Q96DM3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms