Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TM4SF18Q96CE8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms