Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms