Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRG4Q92954 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRG4Q92954 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRG4Q92954 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PRG4Q92954 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRG4Q92954 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms