Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHF3Q92576 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms